福州大学学报（自然科学版）1961年创刊，刊址在福建省福州市大学新区学园路2号。1966年停刊。1978年复刊。1982年正式公开出版发行，季刊。1985年更名为《福州大学学报（自然科学版）》，仍为季刊。1993年起转为双月刊。学报主要刊载数学、计算机科学、物理、电子、电气、信息、控制、机械、材料、土木、建筑、化学、化工、生物、轻工、资源、矿业、环保等方面的最新研究论文。2006年、2008年、2010年，获“中国高校优秀科技期刊奖”。